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LBIOMICDB - Sistema de Gerenciamento de Dados Biológicos para Coleções de Micro-organismos

Última Atualização: 07 Dezembro 2023 Criado: 07 Dezembro 2023

Descrição

O LBIOMICDB - Sistema de Gerenciamento de Dados Biológicos para Coleções de Micro-organismos, tem como objetivo resolver um problema comum em muitos laboratórios que trabalham com micro-organismos: o gerenciamento da coleção. O Pesquisador, além de lidar com o armazenamento e manutenção das linhagens, tem que desenvolver métodos de recuperação de dados biológicos gerados pelas pesquisas taxonômicas e de bioprospecção. Portanto, o LBIOMICDB vem suprir esta necessidade, pois é uma plataforma online e de fácil acesso que facilita a catalogação das Linhagens e/ou Cepas do laboratório e no gerenciamento dos dados biológicos.

Diferencial Tecnológico

O LBIOMICDB é uma ferramenta online que permite de forma fácil e intuitiva catalogar e gerenciar coleções de micro-organismos. Além disso, possibilita usar outras ferramentas da bioinformática como “BLASTN+”, que é um algoritmo para comparar informações de sequências biológicas primárias. Foi construindo em tecnologia de código aberto (Linux “Debian/Ubuntu”, Apache 2, Mysql 5.7 e PHP 7). Portanto, é de fácil implementação em laboratórios e não tem a necessidade de ser instalado em diversos computadores, pois basta dedicar um servidor para tal tarefa. O sistema pode ser instalado em placas embarcadas como o Raspberry pi (mini pc), com processador 1,1 ghz, 256 Mb de Ram e 4gb de HD para seu funcionamento. Um dos poucos sistemas gerenciamentos de coleções micro-organismo disponíveis em língua portuguesa, e que o código fonte (sobre a Licença MIT) possibilita alterações e adequações por parte do usuário/desenvolvedor, conforme a necessidade do laboratório.

Objetivos da Universidade

Utilização em fins acadêmicos, bem como encontrar parceiros interessados no aprimoramento da tecnologia para posterior transferência.

Entre em Contato

Nome do Contato: Angelo J. Marcolino Junior

Função: Responsável pela Divisão de Propriedade Intelectual

E-mail: sec-ptl@uem.br

E-mail Alternativo: nit@uem.br

Telefone: (44) 3011-3861

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