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PROCESSO DE DETECÇÃO DE POLIMORFISMO EM DNA POR MEIO DE ESPECTROSCOPIA FTIR ASSOCIADA A APRENDIZADO DE MÁQUINA

16.12.20

Descrição

O método desenvolvido utiliza espectroscopia FTIR, associada a análise dos espectros por meio de estatística multivariada e aprendizado de máquinas para detectar diferenças entre fragmentos de DNA previamente amplificados pela técnica de PCR. Dessa forma é possível identificar potenciais regiões polimórficas no DNA, e associar essas regiões a características fenotípicas e até enfermidades. A metodologia desenvolvida pode ser utilizada como método de triagem, sendo posteriormente seus resultados confirmados por meio de técnicas mais precisas como o sequenciamento de DNA. Essa triagem prévia pode reduzir em até 90% os custos com sequenciamento de DNA em estudos de prospecção de marcadores genéticos. O processo consiste basicamente em amplificar por PCR fragmentos de DNA dos genes ou regiões genômicas alvo. Em seguida depositar os fragmentos de DNA em placas de silício e capturar os espectros por FTIR. Os espectros são analisados por meio de estatística multivariada e aprendizado de máquinas utilizando algoritmos específicos. O processo de análise de fragmentos de DNA oriundos de diferentes indivíduos permite a identificação de diferenças e agrupamento dos mesmos de acordo com as diferenças no DNA e fenotípicas.

Diferencial Tecnológico

A metodologia desenvolvida pode ser utilizada como método de triagem, sendo posteriormente seus resultados confirmados por meio de técnicas mais precisas como o sequenciamento de DNA. Essa triagem prévia pode reduzir em até 90% os custos com sequenciamento de DNA em estudos de prospecção de marcadores genéticos.

Objetivos da Universidade

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